Debido a la importancia defensiva que tenía Hondarribia para la corona española, los Reyes Católicos ordenaron el suministro de pólvora, arcilla y demás cosas necesarias para la guerra y así fortalecer su defensa.
El polvorín es uno de los almacenes de pólvora que tenia la Ciudad, levantado en el siglo XVII. Se trata de una construcción de piedra de planta rectangular. En su interior podemos destacar una bóveda ojival de cantería. Tenía capacidad para 350 quintales de pólvora (Quintal = antigua unidad de masa española equivalía a 46 Kgs. Hoy en día Quintal métrico = 100 Kgs.).
Actualmente alberga el Centro de interpretación de la ciudad Amurallada y en él se proyecta un audiovisual que ofrece una visión general de la historia de Hondarribia y un paseo por los principales elementos culturales del casco histórico.